№ 2 (20) 2019


по Материалам XVI Международной научной конференции диатомологов «Диатомовые водоросли: морфология, систематика, флористика, экология, палеогеография, биостратиграфия», посвященной 90-летию со дня рождения З.И. Глезер
19 - 24 августа 2019 г.


Филогения и морфология некоторых видов рода Gomphonema Ehrenberg 

Phylogeny and morphology of some species from the genus Gomphonema Ehrenberg

 

Кезля Е.М., Мальцев Е.И., Глущенко А.М., Куликовский М.С.

Elena M. Kezlya, Yevhen I. Maltsev, Anton M. Glushchenko,
Maxim S. Kulikovskiy

 

Институт физиологии растений имени К.А. Тимирязева РАН (Москва, Россия)


УДК 582.261.5

 

Анализируются новые данные по молекулярно-генетическому изучению диатомовых водорослей рода Gomphonema Ehrenberg из разных регионов земного шара.

Ключевые слова: диатомовые водоросли; молекулярные методы; Gomphonema.

 

Одним из крупнейших родов в семействе Gomphonemataceae является род Gomphonema Ehrenberg, который характеризуется гетерополярной симметрией, центральным положением шва, наличием поровых полей в нижней части створки. Отличительной особенностью рода являются однорядные штрихи (редко двухрядные), состоящие из пороидов, закрытых с наружной стороны волой, образующей лишь небольшую с-образную щель, либо округлыми пороидами, с наличием внутри них небольших выростов (Куликовский и др., 2016). Стигма часто присутствует. В тоже время именно этот род отличается от других родов семейства очень большим разнообразием. Морфология многих таксонов не является одинаковой. Ранее в этот род включались все таксоны с гетерополярной симметрией. В работе рассматриваются новые данные по морфологическому и молекулярно-генетическому изучению представителей этого рода из водоемов Москвы, Вьетнама, Эфиопии и других регионов.

В нашем исследовании изменчивости молекулярных маркеров штрих-кода на примере области V4 SSU проанализировано 48 нуклеотидных последовательностей, представляющих 48 моноклональных штаммов диатомовых водорослей из рода Gomphonema. Все штаммы выделены из достаточно удаленных друг от друга пресноводных экосистем как на территории России (оз. Байкал, Карелия, Алтай), так и за ее пределами (Вьетнам, Индонезия, Монголия и Эфиопия). Также в анализ были включены уже депонированные в GenBank последовательности области V4 SSU таких видов Gomphonema как G. acuminatum (KJ011671), G. affine (HQ912608), G. angustatum (KJ011652), G. brebissonii (KJ011653), G. carolinense (KJ011654), G. dichotomum (KJ011655),  G. gracile (KJ011656),  G. intricatum  (KJ011657),  G. parvulum (HQ912595), G. pumilum (KC736629) и G. subclavatum (KJ011666). У исследованных штаммов длина области V4 SSU составила 225–227 п.н. Внутри выравнивания оказалось 53 вариабельных нуклеотидных позиции (23% от всей длины области V4 SSU), при этом последовательности известных видов из GenBank отличались лишь 39 позициях.

Не укорененное Байесовское филогенетическое дерево, построенное на основе полученного выравнивания V4 SSU, показало наличие не менее 35 отличающихся филогенетических линий внутри рода Gomphonema, представленных как одним, так и несколькими штаммами. Следует отметить, что близкие штаммы не всегда соответствовали одному географическому региону. Нами обнаружены клады, в которые вошли представители из географически менее отдаленных районов, например, разных островов Индонезии (штаммы ind95, ind96 и ind302), оз. Байкал и Монголии (mnp151 и B351; B691 и mnp78). Также присутствуют клады, представляющие достаточно отдаленные территории: Карелию и Эфиопию (штаммы ka12 и ef10), Карелию и Монголию (mnp105 и ka10), оз. Байкал и Вьетнам (B300 и VN322). В целом, обнаруженные вариабельные позиции внутри области V4 SSU, приводящие к обособлению отдельных филогенетических линий внутри рода Gomphonema, свидетельствуют о том, что выделенные нами новые штаммы могут быть ранее генетически неизученными уже известными видами или представлять новые линии в Gomphonema.

 

Работа выполнена в рамках грантов РФФИ 17-04-00042-а и 19-34-70016-мол_а_мос.

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов, требующего раскрытия в данном сообщении.

 

Список литературы

  1. Куликовский М.С., Глущенко А.М., Генкал С.И., Кузнецова И.В. Определитель диатомовых водорослей России. – Ярославль: Филигрань, 2016. – 804 с.

Статья поступила в редакцию 1.06.2019
Статья принята к публикации 21.07.2019

 

Об авторах

Кезля Елена Михайловна – Elena M. Kezlya

кандидат биологических наук
старший научный сотрудник, Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН, Москва, Россия (Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia)

melosira@mail.ru

Мальцев Евгений Иванович – Yevhen I. Maltsev

кандидат биологических наук
старший научный сотрудник, зав. Лабораторией молекулярной систематики водных растений, Институт физиологии растений имени. К.А. Тимирязева РАН, Москва, Россия (Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia)

ye.maltsev@gmail.com

Глущенко Антон Михайлович – Anton M. Glushchenko

научный сотрудник, Институт физиологии растений имени. К.А. Тимирязева РАН, Москва, Россия (Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia)

chelovek91_91@mail.ru

Куликовский Максим Сергеевич – Maxim S. Kulikovskiy

доктор биологических наук
ведущий научный сотрудник, зав. Лабораторией молекулярной систематики водных растений, Институт физиологии растений имени. К.А. Тимирязева РАН, Москва, Россия (Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia)

max-kulikovsky@yandex.ru

Корреспондентский адрес: Россия, 127276, г. Москва, Ботаническая ул., 35, ИФР РАН. Телефон (499)678-54-00.

 

ССЫЛКА:

Кезля Е.М., Мальцев Е.И., Глущенко А.М., Куликовский М.С. Филогения и морфология некоторых видов рода Gomphonema Ehrenberg // Вопросы современной альгологии. 2019. № 2 (20). С. 181–183. URL: http://algology.ru/1525

DOI – https://doi.org/10.33624/2311-0147-2019-2(20)-181-183

 

При перепечатке ссылка на сайт обязательна

 

Phylogeny and morphology of some species from the genus Gomphonema Ehrenberg

Elena M. Kezlya, Yevhen I. Maltsev, Anton M. Glushchenko, Maxim S. Kulikovskiy

Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS (Moscow, Russia)

New molecular data on diatoms from the genus Gomphonema Ehrenberg are analyzed.

Key words: diatoms; molecular data; Gomphonema.

 

References

  1. Kulikovskiy M.S., Glushchenko A.M., Genkal S.I., Kuznetsova I.V. Opredelitel diatomovykh vodorosley Rossii [Identification book of diatoms from Russia]. Filigran, Yaroslavl, 2016. 804 p. (In Russ.)

 

Authors

Kezlya Elena M.

Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia

melosira@mail.ru

Maltsev Yevhen I.

ORCID – https://orcid.org/0000-0003-4710-319X, eLIBRARY AuthorID – 745467

Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia

ye.maltsev@gmail.com

Glushchenko Anton M.

ORCID – https://orcid.org/0000-0002-3876-3455

Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia

chelovek91_91@mail.ru

Kulikovskiy Maxim S.

ORCID – https://orcid.org/0000-0003-0999-9669

Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia

max-kulikovsky@yandex.ru

 

ARTICLE LINK:

Kezlya E.M., Maltsev Ye.I., Glushchenko A.M., Kulikovskiy M.S. Phylogeny and morphology of some species from the genus Gomphonema Ehrenberg. Voprosy sovremennoi algologii (Issues of modern algology). 2019. № 2 (20). P. 181–183. URL: http://algology.ru/1525

DOI – https://doi.org/10.33624/2311-0147-2019-2(20)-181-183

When reprinting a link to the site is required

 

Уважаемые коллеги! Если Вы хотите получить версию статьи в формате PDF, пожалуйста, напишите в редакцию, и мы ее вам с удовольствием пришлем бесплатно. 
Адрес - info@algology.ru

 

 

На ГЛАВНУЮ

Карта сайта

 








ГЛАВНАЯ

НОВОСТИ

О ЖУРНАЛЕ

АВТОРАМ

33 номера журнала

ENGLISH SUMMARY

ОБЗОРЫ И СТАТЬИ

ТЕМАТИЧЕСКИЕ РАЗДЕЛЫ

УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКИЕ
МАТЕРИАЛЫ


АКВАРИАЛЬНЫЕ СИСТЕМЫ
И  ИХ  СОДЕРЖАНИЕ


КОНФЕРЕНЦИИ

АЛЬГОЛОГИЧЕСКИЙ СЕМИНАР

СТУДЕНЧЕСКИЕ РАБОТЫ

АВТОРЕФЕРАТЫ

РЕЦЕНЗИИ


ПРИЛОЖЕНИЕ к журналу:


ОБЪЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

ОПРЕДЕЛИТЕЛИ И МОНОГРАФИИ

ОТЕЧЕСТВЕННАЯ АЛЬГОЛОГИЯ
СЕГОДНЯ


ИСТОРИЯ АЛЬГОЛОГИИ

КЛАССИКА
ОТЕЧЕСТВЕННОЙ АЛЬГОЛОГИИ


ПУБЛИКАЦИИ ПРОШЛЫХ ЛЕТ

ВЕДУЩИЕ АЛЬГОЛОГИЧЕСКИЕ
ЦЕНТРЫ


СЕКЦИЯ  АЛЬГОЛОГИИ  МОИП

НАУЧНО-ПОПУЛЯРНЫЙ РАЗДЕЛ

СЛОВАРИ И ТЕРМИНЫ



НАШИ ПАРТНЕРЫ


ПРЕМИИ

КОНТАКТЫ



Карта сайта






Рассылки Subscribe.Ru
Журнал "Вопросы современной альгологии"
Подписаться письмом


Облако тегов:
микроводоросли    макроводоросли    пресноводные    морские    симбиотические_водоросли    почвенные    Desmidiales(отд.Сharophyta)    Chlorophyta    Rhodophyta    Conjugatophyceae(Zygnematophyceae)    Phaeophyceae    Chrysophyceae    Диатомеи     Dinophyta    Prymnesiophyta_(Haptophyta)    Cyanophyta    Charophyceae    бентос    планктон    перифитон    кокколитофориды    Экология    Систематика    Флора_и_География    Культивирование    методы_микроскопии    Химический_состав    Минеральное_питание    Ультраструктура    Загрязнение    Биоиндикация    Размножение    Морфогенез    Морфология_и_Морфометрия    Физиология    Морские_травы    Использование    ОПРЕДЕЛИТЕЛИ    Фотосинтез    Фитоценология    Антарктида    Японское_море    Черное_море    Белое_море    Баренцево_море    Карское_море    Дальний_Восток    Азовское_море    Каспийское_море    Чукотское_море    КОНФЕРЕНЦИИ    ПЕРСОНАЛИИ    Bacillariophyceae    ИСТОРИЯ    РЕЦЕНЗИЯ    Биотехнология    Динамические_модели    Экстремальные_экосистемы    Ископаемые_водоросли    Сезонные_изменения    Биоразнообразие    Аральское_море    первичная_продукция    Байкал    молекулярно-генетический_анализ    мониторинг    Хлорофилл_a    гипергалинные_водоемы    сообщества_макрофитов    эвтрофикация    инвазивные_виды    

КОНТАКТЫ

Email: info@algology.ru

Изготовление интернет сайта
5Dmedia

ЛИЦЕНЗИЯ

Эл N ФС 77-22222 от 01 ноября 2005г.

ISSN 2311-0147